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基因数据处理20之BWASW算法ref分块建立索引然后比对
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-20 热度:190
SRR003161h20.fastq span style="font-family: Arial,Helvetica,sans-serif; font-size: 12px; background-color: rgb(255,255,255);"三次测试:/span hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub$ bwa bwasw GRCH38chr1L3556522.fna SRR003161h20.fast[详细]
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基因数据处理21之BWASW算法ref分块建立索引然后比对(ref切分为
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-20 热度:135
1.时间分析 对ref为单条染色体进行比对,第一次比对在3-5s不等,对chr1-4比对,在20s左右 连续比对多次后,对单染色体比对降到1s左右,chr1-4降到2s左右 不懂为什么比一次比对时间比较长,后面几次比对时间变短 运行代码: hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/[详细]
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基因数据处理22之对GRCH38全基因建立BWA索引
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-20 热度:164
环境: ubuntu 14.04 内存 6G bwa 0.7.12 结论: 建立索引大概4500秒左右 节点2运行: hadoop@Mcnode2:~/cloud/adam/xubo/data/test20160422$ cp ../test20160310/GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna .hadoop@Mcnode2:~[详细]
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产品策略研究期的数据分析与挖掘
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-20 热度:175
万物生长,适者生存,事物发展代谢遵循一定趋势,产品亦然。 策略研究找趋势 在产品设计阶段,第一时期策略研究首先从宏观角度对外部环境和内部情况加以分析,重点关注市[详细]
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基因数据处理23之BWASW算法ref分块建立索引然后比对(ref切分为
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-20 热度:177
结论: read为25000条对单条染色体进行比对需要110秒左右,对chr1-4比对需要160秒左右 运行结果: 1[M::bwa_idx_load_from_disk] read 0 ALT contigs[bsw2_aln] read 17040 sequences/pairs (10000385 bp) ...[bsw2_aln] read 7960 sequences/pairs (4469697[详细]
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教程:手把手教你用永洪敏捷BI做数据可视化
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-20 热度:189
俗话说,工欲善其事,必先利其器。在当前的时代背景下,选择一款合适自己企业的数分析工具,就显得十分重要。下面给大家分享一款业务用户也能轻松进行大数据分析的工具——永洪一站式大数据分析平台。 本文由永洪科技投稿,未经授权转载视为侵权,欲转载者请[详细]
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基因数据处理24之BWASW算法ref分块建立索引然后比对(ref切分为
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-20 热度:57
比默认的要块1倍左右 1[M::bwa_idx_load_from_disk] read 0 ALT contigs[bsw2_aln] read 25000 sequences/pairs (14470082 bp) ...[main] Version: 0.7.13-r1126[main] CMD: bwa bwasw -t 4 GRCH38chr1L3556522.fna SRR003161h100000.fastq[main] Real time:[详细]
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白话空间统计二十一:密度分析(一)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-20 热度:187
白话空间统计二十一:密度分析(一) 密度分析这个概念其实很早就想写了,也有无数同学都问过我,虾神你能不能讲讲那些漂亮的热度图是怎么做的啊?比如下面这种: 如果说,这是互联网地图里面,最让人喜闻乐见的一种空间分析模式(或者是看热闹的同学就认为[详细]
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基因数据处理25之avocado安装
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-17 热度:148
基因数据处理25之avocado安装 下载: git clone https://github.com/bigdatagenomics/avocado.git 安装 第一次失败,第二次成功 hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/code/avocado$ mvn install[INFO] Scanning for projects...[INFO] ------------------------[详细]
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4542: [Hnoi2016]大数 莫队算法
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:172
555我好弱啊 都说今年的HNOI是无脑数据结构赛,都很好想只是码代码的问题,然而我还是不会做这道题。 要退役了啊啊[详细]
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4542: [Hnoi2016]大数|莫队
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:127
HN一天考两个莫队是什么鬼..或者说莫队不是正确的姿势..? 考虑已经知道了 l . . r 的答案新添入 r + 1 如何更新当前答案 需要先预处理出后缀 m o d p 的值 b i ,假设子序列 l . . r 模 p 的值为 x 那么 x ? 10 r ? l + b [ r ] = b [ l ] 然后就可以直接莫[详细]
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手把手:R语言文本挖掘和词云可视化实践
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:140
感谢eBDA 工作室的投稿! eBDA工作室是植根于运营商的一支数据分析团队,是由一群喜欢数据分析和创新的小伙伴组成的,成立两年以来,我们在底层数据存储HDFS/ORCFile,计算框架和资源管理MapReduce/Storm/Spark/Yarn,到数据分析工具Hive/Pig/R/Spss,数据集[详细]
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大数据分析提升电子病历临床价值
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:172
大数据文摘作品,转载需授权 选文:孙强 翻译整理:孙强 ,Dr Guo,? 胡楠,汪霞 医疗服务从业者理应继续使用大数据分析策略将电子健康档案中的信息转换为临床可执行的洞见。 电子健康档案( EHRs )通过病人信息权限的加速获取,工作流程的优化,成本的减少和[详细]
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HDU 1212 Big Number 大数取模
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:118
Big Number ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Time Limit: 2000/1000 MS (Java/Others)????Memory Limit: 65536/32768 K (Java/Others) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Total Submis[详细]
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白话空间统计二十一:密度分析(三)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:183
白话空间统计二十一:密度分析(三) 昨天我们看到的都是一维(单变量平滑)的问题,实际上对于做地理信息的同学来说,这种在一个数轴上展开的各种曲线完全就不符合我们的认知或者审美观嘛……别急,今天开始,我们就把这种抽象的数轴曲线,变成大家喜闻乐见[详细]
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大数加减法-java实现
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:96
计算机的各种数据类型的存储范围有限 在特大数的处理方面 也许需要我们自己去实现 这里就给大家介绍下 大数的加减法处理 大数加法 基本思想是将两个特大的整数利用字符数组作为存储介质 对原有数进行翻转处理 逐位计算 遍历结果逢十进一 代码如下 private st[详细]
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UVA - 10106 Product(大数模板)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:116
The problem is to multiply two integers X,Y . (0 ≤ X,Y 10250) Input The input will consist of a set of pairs of lines. Each line in pair contains one multiplyer. Output For each input pair of lines the output line should consist one integ[详细]
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同一表中重复数据处理
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:191
查询 ? ? ? columnName? 有重复的数据,保留 ? id ? ?最大的一个。 SELECT?MAX(id)?AS?id,?columnName,?COUNT(columnName??)?AS?countNumberFROM?tableNameGROUP?BY?columnNameHAVING?countNumber?1ORDER?BY?countNumber?DESC; 删除 ? ? columnName ? ?有重[详细]
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企业如何建设BI商业智能系统
所属栏目:[大数据] 日期:2021-05-16 热度:159
随着商业智能和大数据价值的不断深入人心,各行各业都对 BI 商业智能 系统有了不同程度的探索。据悉,商业智能的应用每年正以5%~6%的速率增长,中小企业的形势尤为迅猛,其应用范围大到全面布局,小到具体业务,帮助企业利用数据分析企业运行现状,制定科学[详细]
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第10章-基于树的方法(1)-生成树
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-19 热度:197
原文参考:https://onlinecourses.science.psu.edu/stat857/node/22 一,本章简介 1,本章主要学习目标 理解决策树的基本概念 理解构成决策树的三个基本元素 理解’不纯度’及其他度量公式的定义 知道如何估计每个树节点的各个所属分类的后验概率 理解基于树[详细]
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数据处理1:一个中型数据的数据处理平台构建
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-19 热度:66
数据是这个样子的 大概一共有两万多行,我需要对每一行进行逗号的分隔解析,然后把数据重新输出 方法是把它存为文件,然后通过文件读取的方式去读取这些数据,读取一行然后进行处理让其变成单个字符串并进行显示 我这里用的是 结构体存储 的方法,并且 分割[详细]
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大数据分析平台搭建教程:基于Apache Zeppelin Notebook和R的交
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-19 热度:192
介绍 这篇文章的目的是帮助您开始使用 Apache Zeppelin Notebook,它可以满足您用R做数据科学的需求。Zeppelin 是一个提供交互数据分析且基于Web的笔记本。方便你做出可数据驱动的、可交互且可协作的精美文档,并且支持多种语言,包括 Scala(使用 Apache Spa[详细]
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四大主流开源BI商业智能平台对比评测
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-19 热度:169
概述: 本文对主流的四款开源BI商业智能平台进行了对比,主要从三方面入手,文档、演示和架构体系。 一、文档篇 完善的文档对平台的学习和使用是非常有用的,也是判断平台是否优秀的一个最直观的方法,所以我们有理由来比较一下四个平台的文档。 openI的文档[详细]
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HDU 1502 三维dp加大数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-19 热度:134
F[a][b][c]=F[a-1][b][c]+F[a][b-1][c]+F[a][b][c-1]; a=b=c; package zzz;import java.math.BigInteger;import java.util.Scanner;public class Main {public static void main(String args[]){Scanner cin=new Scanner(System.in);BigInteger a[][][]=new[详细]
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上机题目(初级)-大数求和
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-19 热度:177
描述:? 给定两个非常大的正整数A和B,位数在50至100之间。求C=A+B; ? 题目类别: ?字符串? 难度: ?中级? 运行时间限制: 10Sec 内存限制: 128MByte 阶段: ?入职前练习? 输入: ? 因为A和B很大,从高位到低位,以字符串的形式输入两行数字A和B。A和B的位数在50[详细]